Кстати, как в Nautilus задать права su? Чтобы можно было прямо в нём править файлы в /etc/, например?
Это же неудобно. Куда проще открывать конфиги из консоли используя автодополнение. Как эмулятор терминала советую yakuake. Если все же очень хочется именно наутилус - его можно из той же консоли запустить.
И ещё такой вопрос, шелл-скрипт, если его запихать в init.d, будет сам понимать, что нужно выполнить start? Если его просто запустить, то он пишет про то, какие команды доступны (start|stop|restart). И ничего о том, запустился уже авторизатор или нет.
Бывают совершенно разные системы стартовых скриптов, все зависит от дистрибутива.